海洋学院（食品工程学院）是学校打造海洋特色的排头兵学院，有“海洋科学”学术性硕士点一个，“渔业”和“食品加工与安全”农业推广专业硕士点两个。“海洋科学与技术”学科为江苏省唯一的海洋类优势学科，“生物工程”学科为江苏省重点建设学科，“水产养殖”和“水产品加工”为校级重点学科。学院设有海洋科学、海洋资源与环境、水产养殖、食品工程、生物工程、生物技术六个系和一个实验中心，现有海洋科学、海洋资源与环境、海洋管理、水产养殖、食品科学与工程、生物技术、生物工程、动植物检疫和水族科学与技术九个本科专业，其中水产养殖专业为国家级特色建设专业点，食品科学与工程专业为淮海工学院品牌专业。
海洋学院是学校规模和综合实力最强的学院之一，学院107名教职工中专任教师78名，51名教师具有高级职称，其中教授17人，具有博士学位45人，在读博士 12人，青年教师全部具有硕士以上学位。近几年，1 位教师享受政府特殊津贴，1位教师入选“香江学者”， 6 位教师被列为江苏省 “333 新世纪科学技术带头人培养工程 ” 培养对象， 5 位教师被评为江苏省教育厅 “ 青蓝工程 ” 优秀青年骨干教师，4位教师被列为江苏省“ 六大人才高峰”培养人选，8 位教师被列为连云港市 “521 新世纪高层次人才培养工程 ” 培养人选，有 10位教师先后到美国、加拿大、日本、德国和澳大利亚进行博士后和访问学者的研究。近三年，教师在国内外学术期刊发表论文500多篇，被SCI、EI收录80多篇，出版学术专著和教材多部，申请发明专利80多项。获国家科技进步二等奖1项，国家海洋局创新成果奖二等奖2项、江苏省海洋与渔业科技创新三等奖2项、连云港市政府科技进步奖一等奖1项，二等奖多项。目前承担各级各类项目140多项，其中主持国家自然科学基金项目7项、承担国家自然科学基金项目3项、承担国家科技部支撑项目2项，国家科技部863计划项目1项，国家海洋公益项目3项，主持国家重点实验室项目1项，主持江苏省科技厅项目13项、主持省高校自然科学研究重大项目3项。
海洋学院教学条件和教学环境较好，海洋楼建筑面积近
12000平方米
，仪器设备总值2000多万元，设有“江苏省海洋生物技术重点实验室”、“江苏省生物学实验教学示范中心”。中央与地方共建的“海洋生物工程实验室”和“海洋生物资源开发与加工实验室”、“海洋生物技术实验室”、“海洋生物学实验室”和“水产养殖学实验室”；与江苏省海洋渔业局共建的“江苏省沿海特色水产品加工研究开发中心”、“江苏省海水养殖甲壳类种质资源研究中心”、“江苏省海水甲壳动物遗传育种重点实验室”和“江苏海水养殖动物病害重点实验室” 等多个研发平台。学院拥有200余亩水产养殖基地，并建成榆城集团、中洋公司、三得利公司、雨润公司等稳定的实习实训基地20多个。
教学和人才培养质量高。学院以科学研究、学科建设促进专业建设，不断提高教学质量。2012年“水产养殖学”获得教育部高等学校“专业综合改革试点”项目，“水产类”（涵盖水产养殖学、海洋科学）获批“十二五”江苏省高等学校重点专业。2012 年获得“挑战杯”第七届江苏省大学生创业计划竞赛获铜奖，获得国家级本科训练计划创业实践类资助项目1项。连续多年超过五分之一的本科毕业生考取研究生，考研率位居全校榜首。2014届考研成功的近60名毕业生中，有56%同学考取了“985”和“211”大学。
海洋学院在党政领导班子的带领下，以本科教学为中心，科学研究为突破口，实验室建设为抓手，注重规模与质量、结构与效益相统一，实践人才培养、科学研究和社会服务三大基本功能，为创办江苏海洋大学作出应有的贡献。
